Indonesia sebagai negara yang berdaulat penuh saat ini telah dan sedang terus mengupayakan dapat menjalin kerjasama internasional yang baik dengan pihak luar negeri. Kerjasama tersebut dilakukan secara bilateral, regional maupun multilateral. Kerjasama ini dilakukan dalam rangka mendukung kepentingan nasional Indonesia yang lebih strategis dan juga untuk upaya peningkatan pembangunan nasional Indonesia termasuk didalamnya adalah kerjasama bidang kelautan dan perikanan.

Sebagaimana diketahui bersama bahwa perkembangan pembangunan kelautan dan perikanan Indonesia pada saat ini mengalami banyak kemajuan dan juga tantangan. Kemajuan dan tantangan yang ada saat ini tidak hanya dipengaruhi dari tumbuhnya kesadaran akan pentingnya memanfaatkan pembangunan dari sektor ini didalam negeri namun juga karena adanya pengaruh dari luar Indonesia. Hal ini tentu disadari oleh kita bersama bahwa era globalisasi saat ini memunculkan dampak yang semakin serius dan kompleksnya issu dan permasalahan yang dihadapi dalam pembangunan perikanan nasional yang berkelanjutan.Pelabuhan Perikanan Nusantara Pemangkat mulai dibangun pada tahun anggaran 1977 / 1978, dengan pertimbangan guna mendukung ekonomi daerah  perbatasan (Border Trade) dengan negara Malaysia. Jarak Border Trade tersebut sekitar + 400 km yaitu Entikong yang berbatasan langsung dengan Sarawak, dan saat ini telah terbuka akses menuju Sarawak melalui border trade di Kabupaten Sambas yaitu Border Aruk Sajingan Sambas (Indonesia) – Biawak (Malaysia) yang sudah diresmikan pada tanggal 1 Januari 2011, yang berjarak + 80 km dari lokasi Pelabuhan Perikanan Nusantara Pemangkat<!--![endif]---->