Pelayan Teknis Kapal Perikanan di Pelabuhan Perikanan Nusantara Sibolga diselenggarakan secara terpadu pada satu ruang di Kantor Utama Pelabuhan Perikanan Nusantara Sibolga, meliputi Pelayanan Kesyahbandaran Kapal Perikanan, Penerapan Log Book, Pelayanan Perizinan Usaha Perikanan dan Pelayanan Sertifikat Hasil Tangkapan Ikan (SHTI).