Pada tanggal 20 juli 2016 Pelabuhan Perikanan Nusantara Sibolga kembali mengukir prestasi mendapat penghargaan peringkat kedua penilaian kinerja satuan Kerja Periode Semester I Tahun 2016, dari KPPN Sibolga Ditjen Perbendahaan Kementerian Keuangan Republik Indonesia.
Pada acara tersebut yang hadir dan menerima Piagam Penghargaan tersebut mewakili kepala PPN Sibolga Bapak Rafizal Kamaruddin, A.Pi, SE, M.Si (Kasubbag Tatausaha), hal disebabkan karena beliau sedang bertugas diluar kota. Penghargaan tersebut diberikan langsung oleh Kepala Kantor KPPN Sibolga Bapak Purwadhi Adhiputranto kepada Bapak Rafizal Kamaruddin, A.Pi, SE, M.Si (Kasubbag Tata Usaha PPN Sibolga) di Ruang Aula Lantai 2 KPPN Sibolga jalan Dr. Sutomo No 7 Sibolga. Untuk Peringkat Pertama diraih Distrik Navigasi Sibolga dengan Total Nilai 94,50, Peringkat Kedua diraih oleh Pelabuhan Perikanan Nusantara Sibolga dengan Total Nilai 91,00 dan Peringkat Ketiga diraih oleh Polres Tapanuli Tengah dengan Total Nilai 89,50. Dengan diterimanya berbagai penghargaan dari Pemerintah yang diberikan kepala PPN Sibolga diharapkan menjadi Motivasi Kinerja Seluruh Instansi yang ada di wilayah Sibolga dan Tapanuli Tengah, serta Penghargaan yang sudah diberikan dipertahankan agar kedepan lebih baik lagi.